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零基础靶区勾画——肝癌篇

2022-07-14 14:20:04

下面是小编为大家整理的零基础靶区勾画——肝癌篇,供大家参考。

零基础靶区勾画——肝癌篇

 

 零基础靶区勾画——肝癌篇 1 1 肝癌的影像学表现 作为消化系统常见实体恶性肿瘤,我国肝癌(主要是原发性肝癌)发病率较高,预后较差。原发性肝癌主要包括肝细胞癌、肝内胆管癌和混合型肝细胞癌-胆管癌三种不同病理学类型, ,本文中的“肝癌”仅指“ 肝细胞癌”( (https://caivd-org.cn/webfile/file/20220118/2022011817110387387.pdf )。

 肿瘤病灶引发的 组织器官解剖学亦或是组织密度改变是基于超声、CT 等影像学技术的早期筛查与诊断的基础。

 在我们日常见到的 CT 平扫片中,正常肝脏呈现 均匀密影 度软组织影(50-60Hu),密度高于肝脏周围的脾、胰腺、肾等组织,简单识别 Tips:正常肝脏组织相比于脾、肾等组织要白一点)。

 在肝门层面还可见肝动静脉、门静脉、胆管等不规则低密度影(Tips:在 CT 断层图像中,对于不确定的血管等结构,可连续观察多个层面进行跟踪辨认;也可借助 增描 强扫描进行对比观察)。

 正常肝脏 CT 平扫影像学表现 所谓增强扫描,即引入与人体组织密度差别较大的药物(即造影剂/对比剂),在影像图片上形成组织密度差异较大的图像,易于观察。

 在肝脏的增强扫描中,由于脉 肝脏双重血供(肝动脉+门 门)

 静脉)的特点,整个肝脏图像呈现 三个时相的动态变化:动脉期-门脉期-延迟期。

 敲黑板!敲黑板!上述三个时相图像特点是肝脏疾病影像诊断的重要参考,待 Nothing 向大家详细讲述:

 动脉期:顾名思义,造影剂由注射后分布于动脉内,所以本期最大的特点就是 腹主动脉成高密度影,图上可以看到脊柱侧前方连续性白色的血管影。

 此外,血供丰富的组织如肾皮质呈现明显强化,脾呈现部分强化(这种部分强化,部分非强化,亮暗相间的图像,我们又称为花脾)。对于肝脏,由于大部分血供来源于门静脉,此期正常肝脏并未强化,较暗。

 门脉期:此期造影剂主要分布于门静脉系统内,门静脉系统为肝脏主要的血供来源。在此期,我们可以看到主动脉影强化减退, 门静脉呈现密度较高的白色, 肝实质、肾实质、脾均呈现均匀强化,即“图像变白”。

 延迟期:在此期肝动静脉系统内均有造影剂分布,主要用于观察病灶内的强化情况。一些血管异常,造影剂排空减缓的疾病如 肝血管瘤,在此期呈现高密度影。

 肝脏增强扫描三期 CT 表现(白圈范围即为肝癌癌灶)

 前文提到, 解剖学或者组织密度的改变是影像图像上辨别疾病的基础。病灶的发现就像是给两张图片找不同,同一部位与正常影像差异越大约有可能是病灶所在的部位。

 在 CT 平扫中,与大体分型对应, 原发性肝癌病灶可表现为巨块状或结节状。与正常肝组织相比, 癌灶主要表现为低密度病灶,少数也可为混合密度病灶。

 肿瘤体积较大时,由于病灶可发生出血、坏死等改变,CT 影像上会出现密度不均一病灶。肝癌病灶边界多不清,较为模糊,也成为肿瘤靶区勾画的难点。

  原发性肝癌 CT 平扫影像学表现(白色箭头为癌灶)

 此时我们就要借助于增强 CT, 由于肝癌病灶主要由肝动脉供血且一般血供较为丰富,造影剂到达早于由门静脉主要供血的肝实质,呈现出短暂的 高密度区(比较白),但清除出肝较快,后期则表现为 低密度区,体现出“ 快进快出”的特点,类似于走双向八车道的高速公路,路宽车少,造影剂在高速上跑的非常快,即在影像上表现为暗-亮-暗的表现; 而肝实质中的造影剂仿佛在走两车道的盘山路,绕弯而缓慢,影像上表现为缓慢增亮-缓慢变暗的表现;进而由此与正常肝脏组织相区别(Fig 3)。

  原发性肝癌 CT 增强扫描影像学表现(白色箭头为癌灶)

 左图:动脉期;右图:门脉期 2 2r 3D Slicer 勾画肝癌靶区 3D Slicer 是一款优秀的免费开源医学图像处理软件,可兼容 Win/MacOS/Linux 等多种系统,具备强大

 的扩展性,大家可以从官方网站(https://www.slicer.org/)下载相应版本。

 本文使用的是 3D Slicer v4.10.2 版本向大家简单展示肝癌病灶的靶区勾画过程。需要注意:3D Slicer 处理的影像学原始图像须为 DICOM 格式(.dcm 文件),否则无法识别。

 我们先来认识一下这款软件,3D Slicer 界面较为简洁,主要的功能键安排在上方的功能菜单栏中:

  常用功能:

 DCM 格式图像导入:

 图像序列及数据列表:Data 选项

 图像参数及窗宽/窗位调整:Volumes 选项

 靶区勾画:Segment Editor 选项

 图像显示区显示方式:Four-Up 选项

 功能键的下方,便是软件主界面。左侧则为图像序列信息及状态显示区,右侧即为图像显示区:

  下面 Nothing 就以临床确诊的肝癌患者 CT 增强图像为例,简单演示肝癌病灶的识别与靶区勾画过程:

 1. 图像导入:DICOM 格式的图像文件可由软件左上角菜单栏中 DCM 图标按钮进行导入,导入后会在右侧图像显示区出现该图像序列横断位、矢状位、冠状位的影像图(如上图示)。

 我们在此采用动脉期影像(Arterial phase, AP)作为示例。在 Data 选项卡中 ,选中动脉期图像后,点击序列后的眼睛图标即可显示出该序列的 CT 图像:

  修改命名:由于各影像命名并不一致,我们可以目标影像进行统一修改命名,方便后续查找与其他操作。

 比如动脉期命名为 AP,同时将分析不需要的图像序列删除,例如:

  2. 调整图像的窗宽与窗位:让肿瘤病灶与周围正常组织分界更清楚。我们只需要长按鼠标左键沿着影像的对角线移动,可以提高或降低各组织的对比度(即窗宽与窗位),影像变白或变黑)。

 但是!对于新手而言,手动调整窗宽窗位后经常会出现的状况是:咦,影像怎么白了?黑了?模糊了?原来还稍微清晰的图像怎么再也调不回去了? 在这里,Nothing 就来分享一个小妙招。在 Volumes 选项卡 中调整该序列的窗宽(W)与窗位(L),3D Slicer软件已经预设了常见的肺窗、软组织窗、骨窗等,当然大家也可根据自己的经验手动设置。

  3.病灶的识别:一般 Nothing 习惯调整好图后先将图像整体浏览一遍,初步了解下病灶的位置、大小、密度等 ,重点关注肝脏中密度不均匀的组织影。

 在本例中,我们可以看到动脉期该肝脏右叶有一巨大稍高密度灶(白色箭头所示),内部密度不均一,中央多个有较低密度影(一般为肿瘤坏死灶),整个病灶与周围分界不是很清晰,在结合该病灶门脉期(Portal venousphase, PVP)呈现低密度影,基本复合肝癌的

 影像学表现。So Nothing 提醒,判别肝癌病灶时,结合期 动脉期+ 门脉期可更准确的找到靶病灶。

  动脉期静脉期(白色箭头即为癌灶)

 4. 病灶靶区勾画:Ok,学会了如何识别病灶,下一步我们正式开始勾画靶区病灶。

 依然是以动脉期的图像为例。首先将我们的图像界面的四格画面转换为仅有横断面的单格画面,这样图像更大,易于勾画:选 Four-Up选项卡中的 Red slice only 选项

 靶区勾画我们使用 Segment Editor 选项 :在左侧勾画页面中的 Segmentation 栏内选择 Creat new segmentation as….,对新建的靶区命名,一般建议命名体现靶区特征便于后续识别,例如“SegAP”。

 选好我们要勾画的图像序列(例如动脉期序列)后,我们可以在 Data 界面中将其他序列的图像删去,保证靶区层面的勾画准确。

 之后,在我们新建的 SegAP 靶区层面点击 Add,创建新的靶区,同样,我们命名为 SegAP

  下来,我们就可以选用该选项卡中的 Draw 工具进行靶区勾画啦。选中之后鼠标会变为铅笔样,这样单击鼠标连续在 横截面图像中围绕肿瘤边缘勾画即可(图中黄色实线)。

  勾画完毕单击右键确认靶区,此时靶区会被浅绿色覆盖,代表该层面靶区已经勾画完成。剩下的就是一层一层慢慢勾画靶区就可以啦。如果勾画过程中需要修改靶区,大家可以试试 Paint 与 Erase 工具,此外别忘了快捷键 Ctrl+Z 可以撤销上一步操作哦

  Tips:

 a.3D Slicer 软件默认鼠标中键滚轴上下滚动用于调节图像不同层面;单击鼠标中键拖动可以调整图像位置;

 b.在不选用任何工具的情况下,单击鼠标左键并滑动用于调整图片的窗宽与窗位; c.单击鼠标右键并滑动用于调整图像大小 1.靶区浏览与 Binary labelmap 生成:

 在勾画完成后,我们返回 Four-Up 四格图像界面,此时可以从横断面、冠状面及矢状面观察我们所画的靶区,右上方格中可以看到勾画靶区的三维图像。

  后续的影像组学分析过程中,需要把靶区的图像数据转换为二进制数据(binary data)进行分析。因此我们回到 Data 界面,选中刚创建的 SegAP 靶区,右键勾选 Export visible segments to binary labelmap,即可生成 SegAP-label 数据,如图示

  2.靶区勾画数据的保存:

 结束了上面的步骤,我们靶区勾画也就要接近尾声啦。下面我们将所有的勾画数据导出存盘,使用最上方菜单栏中的 Save 选项 ,此时弹出我们要保存的 5个文件:*.mrml 文件,3 个*.nrrd 文件和*.ctbl 文件。可对文件名作必要的简化。

 需要注意的是,上述文件的保存路径(Directory)

 需要文 统一且路径名中不可有中文,路径名可通过 Change directory for selected files 选项进行修改。最后,单击Save 进行保存。

  至此,我们肝癌的病灶识别与 3D Slicer 靶区勾画工作就完成啦,后续的进一步分析就可以由今天保存的这几个文件继续进行。整个勾画过程步骤还是偏多,大家可以先利用手边的影像学数据练起来,熟能生巧。

 3 3 Summary 1.CT 图片中的病灶识别多基于解剖学改变或者组织器官的密度改变,因此组织结构的正常影像学 CT 结构的认识与积累至关重要。在分析过程中,多选用增强CT 进行病灶识别与靶区勾画; 2.使用 3D Slicer 软件导入 DICOM 格式(.DCM)的影像学原始图像可进行靶区勾画在内的多种分析与操作,最终生成含有图像二进制标签信息的多种文件供后续分析;

 3.多加练习方可熟能生巧。

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